Axes de recherche

L'épithélium des voies respiratoires joue un rôle clé en tant que première ligne de défense des poumons contre les infections, en agissant non seulement comme une barrière physique mais aussi en régulant finement les réponses immunitaires innées et adaptatives.

Les réponses immunitaires précoces induites localement dans le nasopharynx sont des déterminants majeurs de la physiopathologie et du devenir des infections virales respiratoires, y compris la physiopathologie et la transmission. Ce programme combine l’utilisation de virus sauvages et recombinants (influenza, pneumovirus, coronavirus) avec un large panel de modèles précliniques in vitro prédictifs et in vivo, et des approches complémentaires de biologie cellulaire/moléculaire, d'imagerie et d'Omics pour la caractérisation approfondie des interactions fonctionnelles entre le virus et l'hôte. Outre la contribution évidente aux aspects fondamentaux de la biologie des virus respiratoires, ce programme de recherche a le potentiel d'identifier des biomarqueurs d'infection et de gravité, ainsi que des cibles médicamenteuses potentielles contre les virus à potentiel épidémique, zoonotique et pandémique.

Ce programme est basé sur une approche croisée de caractérisation de signatures transcriptomiques cellulaires (chémogénomique et virogénomique) pour l’identification de molécules ciblant les machineries cellulaires détournées par les virus respiratoires, de modélisation 3D d’interactions potentielles par « Docking » de molécules candidates à différents déterminants viraux, et de combinaison en bi- et trithérapies visant à des efficacités antivirales à large spectre, tout en minimisant les risques d’émergence de résistance virale.

Il repose sur deux piliers complémentaires : L'analyse bioinformatique et l’intégration intelligente de différentes données OMICS issues du séquençage NGS d'échantillons de patients et de modèles précliniques d’infection avec des données de criblages virtuels de chimiothèques et de modélisation par docking moléculaire. L’évaluation des combinaisons de molécules candidates avec un large panel de modèles précliniques in vitro prédictifs et in vivo d’infection par les virus influenza, les pneumovirus et les coronavirus.

Les vaccins viraux vivants atténués (LAV) administrés par voie intranasale (IN) sont considérés comme une stratégie de choix pour la population pédiatrique car ils imitent l'infection virale naturelle tout en provoquant des réponses muqueuses et cellulaires robustes sans nécessiter d'adjuvant.

Cet axe poursuivra la valorisation de la plateforme innovante et polyvalente LAV METAVAC® validée au stade préclinique in vivo en développant plusieurs candidats vaccinaux bi- et tri-valents contre les infections virales respiratoires, et en caractérisant de manière plus approfondie leurs réponses immunitaires mucosales et systémiques dans plusieurs modèles animaux. Leur administration par voie intranasale sera comparée à la voie d’administration intramusculaire d’autres stratégies vaccinales (protéine recombinante ou ARNm) pour la durabilité de la protection et notamment vis-à-vis de la transmission inter-individus.